Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE7Q9UBL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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