Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms