Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK12Q9NYV4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms