Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms