Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms