Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDT1Q9H211 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms