Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms