Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms