Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms