Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF1Q92879 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CELF1Q92879 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF1Q92879 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF1Q92879 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CELF1Q92879 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CELF1Q92879 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF1Q92879 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF1Q92879 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF1Q92879 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF1Q92879 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CELF1Q92879 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CELF1Q92879 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CELF1Q92879 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CELF1Q92879 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CELF1Q92879 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CELF1Q92879 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CELF1Q92879 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF1Q92879 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms