Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYT2Q8N9I0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT2Q8N9I0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms