Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP2LQ8IYA6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms