Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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