Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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