Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TAF1CQ15572 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1CQ15572 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1CQ15572 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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