Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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