Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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