Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 HSP82YPL240C 2130 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 YEL045CYEL045C 426 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 RNA15YGL044C 891 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 ECM34YHL043W 513 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 YLR374CYLR374C 390 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 RNA1YMR235C 1224 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 ATG8YBL078C 354 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 PHO87YCR037C 2772 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 MNN1YER001W 2289 nt3.92□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 PHM7YOL084W 2976 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 UBP6YFR010W 1500 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 MIH1YMR036C 1665 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 EAR1YMR171C 1653 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 TEL1YBL088C 8364 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 RKM3YBR030W 1659 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 FOX2YKR009C 2703 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 SWP82YFL049W 1872 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 YIL152WYIL152W 708 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 OAR1YKL055C 837 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 BOP2YLR267W 1713 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 FBP1YLR377C 1047 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 TRM44YPL030W 1704 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 INA17YPL099C 549 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 ARC40YBR234C 1155 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 RER1YCL001W 567 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 YPS7YDR349C 1791 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 GDE1YPL110C 3672 nt3.91□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 GDH2YDL215C 3279 nt3.9□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 YIL001WYIL001W 1542 nt3.9□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 HOT1YMR172W 2160 nt3.9□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 MST1YKL194C 1389 nt3.9□□□□□ -1.78
PRP46Q12417 COS7YDL248W 1152 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 NUP42YDR192C 1293 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 COS5YJR161C 1152 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 FMP46YKR049C 402 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 YIM1YMR152W 1098 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 RRP40YOL142W 723 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 snR19snR19 568 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 GCR1YPL075W 2358 nt3.9□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 STR2YJR130C 1920 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 TRM13YOL125W 1431 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 PUF2YPR042C 3228 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 TYS1YGR185C 1185 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 LOH1YJL038C 660 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 DAN1YJR150C 897 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 CPR6YLR216C 1116 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 VPS71YML041C 843 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 IBD2YNL164C 1056 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 VPS68YOL129W 555 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 SPN1YPR133C 1233 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 YCL022CYCL022C 516 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 THI20YOL055C 1656 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 FAA1YOR317W 2103 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MMT1YMR177W 1533 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 PAH1YMR165C 2589 nt3.89□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MDR1YGR100W 2853 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 RPP1AYDL081C 321 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 AIM7YDR063W 450 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 SLX8YER116C 825 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 WSS1YHR134W 810 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 SNL1YIL016W 480 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MNN11YJL183W 1269 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MMM1YLL006W 1281 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 PSR1YLL010C 1284 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 NKP2YLR315W 462 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 SWC7YLR385C 399 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 YLR402WYLR402W 192 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 IDI1YPL117C 867 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 KIN2YLR096W 3444 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MUP3YHL036W 1641 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MSN4YKL062W 1893 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 ALE1YOR175C 1860 nt3.88□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 NPL4YBR170C 1743 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 DIT2YDR402C 1470 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 NUP133YKR082W 3474 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 snR7-SsnR7-S 179 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MMS2YGL087C 414 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 RPS4BYHR203C 786 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 YIL171WYIL171W 330 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 RPS4AYJR145C 786 nt3.87□□□□□ -1.79
PRP46Q12417 MRT4YKL009W 711 nt3.87□□□□□ -1.79
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