Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SUB1P53999 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.354e-13■■■■■ 33
SUB1P53999 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 33
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SUB1P53999 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 33
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SUB1P53999 WDR61-210ENST00000559940 3629 nt5.34□□□□□ -1.555e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 33
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