Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms