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Protein–RNA interactions for Protein: P47057
SNX4, Sorting nexin-4, yeast
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423 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SNX4
P47057
YAP1802
YGR241C
1707 nt
3.73
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
MMT1
YMR177W
1533 nt
3.72
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
RTT103
YDR289C
1230 nt
3.72
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
SPT4
YGR063C
309 nt
3.72
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
VPS29
YHR012W
849 nt
3.72
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
ATP14
YLR295C
375 nt
3.72
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
CKB2
YOR039W
777 nt
3.72
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
MST1
YKL194C
1389 nt
3.72
□□□□□ -1.81
SNX4
P47057
MTC1
YJL123C
1437 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
EMC1
YCL045C
2283 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
NBP2
YDR162C
711 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
MIG3
YER028C
1185 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
RPB3
YIL021W
957 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
AIR1
YIL079C
1083 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YLR122C
YLR122C
378 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YMR114C
YMR114C
1107 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
IDH2
YOR136W
1110 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
NUP159
YIL115C
4383 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YDL109C
YDL109C
1944 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
PRP22
YER013W
3438 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SPT6
YGR116W
4356 nt
3.71
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SER33
YIL074C
1410 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YER076C
YER076C
909 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
tS(AGA)D3
tS(AGA)D3
83 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YNG2
YHR090C
849 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
BUD28
YLR062C
378 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
PNP1
YLR209C
936 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
RFA2
YNL312W
822 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YOR292C
YOR292C
930 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SSO1
YPL232W
873 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
EFM2
YBR271W
1260 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
POL1
YNL102W
4407 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
ELM1
YKL048C
1923 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
IDS2
YJL146W
1410 nt
3.7
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YHR214C-E
YHR214C-E
300 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
LDB18
YLL049W
540 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YAR070C
YAR070C
300 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
ARG80
YMR042W
534 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
PRE7
YBL041W
726 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
HEM15
YOR176W
1182 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
FDH2
YPL275W
711 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YIL001W
YIL001W
1542 nt
3.69
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SYT1
YPR095C
3681 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
DIT2
YDR402C
1470 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
CLB4
YLR210W
1383 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SPT16
YGL207W
3108 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YDR431W
YDR431W
312 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YHR112C
YHR112C
1137 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YKR104W
YKR104W
921 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YLR283W
YLR283W
945 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
GTR1
YML121W
933 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
TOM40
YMR203W
1164 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SER1
YOR184W
1188 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SNF8
YPL002C
702 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
ACE2
YLR131C
2313 nt
3.68
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
FKH1
YIL131C
1455 nt
3.67
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
APE2
YKL157W
2859 nt
3.67
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YGL108C
YGL108C
423 nt
3.67
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YGR126W
YGR126W
693 nt
3.67
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
MRP8
YKL142W
660 nt
3.67
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
VPS36
YLR417W
1701 nt
3.67
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YOR022C
YOR022C
2148 nt
3.67
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
RPO21
YDL140C
5202 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
TYW3
YGL050W
822 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YLR407W
YLR407W
687 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
SAP30
YMR263W
606 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
YNG1
YOR064C
660 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
PMT6
YGR199W
2280 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
STU1
YBL034C
4542 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
PEX1
YKL197C
3132 nt
3.66
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
TUB2
YFL037W
1374 nt
3.65
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
MSN4
YKL062W
1893 nt
3.65
□□□□□ -1.82
SNX4
P47057
ARO2
YGL148W
1131 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
TOM20
YGR082W
552 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
YJR096W
YJR096W
849 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
SOD1
YJR104C
465 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
PML1
YLR016C
615 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
RPP0
YLR340W
939 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
YLR428C
YLR428C
345 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
MRPL4
YLR439W
960 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
AIF1
YNR074C
1137 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
YPL088W
YPL088W
1029 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
BRE4
YDL231C
3378 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
CHL1
YPL008W
2586 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
BUD27
YFL023W
2391 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
BYE1
YKL005C
1785 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
DIT1
YDR403W
1611 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
YER134C
YER134C
537 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
RDN5-1
RDN5-1
121 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
RDN5-6
RDN5-6
121 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
RPC19
YNL113W
429 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
snR37
snR37
386 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
snR3
snR3
194 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
YLR352W
YLR352W
2424 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
RPN5
YDL147W
1338 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
TRM11
YOL124C
1302 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
SRS2
YJL092W
3525 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
GAC1
YOR178C
2382 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
SNM1
YDR478W
597 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SNX4
P47057
VFA1
YER128W
612 nt
3.63
□□□□□ -1.83
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