Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	TRM8	YDL201W	861 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YDR445C	YDR445C	408 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	FUR1	YHR128W	651 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	USA1	YML029W	2517 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	ALG5	YPL227C	1005 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	PWR1	PWR1	941 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	TCB3	YML072C	4638 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	MEF2	YJL102W	2460 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	GCV1	YDR019C	1203 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	NBP2	YDR162C	711 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	SIW14	YNL032W	846 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YND1	YER005W	1893 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	THI7	YLR237W	1797 nt		4.07	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	ALG2	YGL065C	1512 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	WHI4	YDL224C	1950 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	IES6	YEL044W	501 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	FLD1	YLR404W	858 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	ASC1	YMR116C	960 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YMR130W	YMR130W	909 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YPK9	YOR291W	4419 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.06	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YBR225W	YBR225W	2703 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	SPC19	YDR201W	498 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	PCL6	YER059W	1263 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	IGO2	YHR132W-A	396 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	TDA5	YLR426W	981 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	SHE1	YBL031W	1017 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	MCM1	YMR043W	861 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	RCM1	YNL022C	1473 nt		4.05	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	RKM2	YDR198C	1440 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	SRP72	YPL210C	1923 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	MSW1	YDR268W	1140 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	ACT1	YFL039C	1128 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	RPS0A	YGR214W	759 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	GMH1	YKR030W	822 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	TOM7	YNL070W	183 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	MOT2	YER068W	1764 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	STP4	YDL048C	1473 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	SEN1	YLR430W	6696 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	TMN2	YDR107C	2019 nt		4.04	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YIL092W	YIL092W	1902 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	PIM1	YBL022C	3402 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	KTR7	YIL085C	1554 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YDR230W	YDR230W	348 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YHR173C	YHR173C	339 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	OCA1	YNL099C	717 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	CWC25	YNL245C	540 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	RPL18B	YNL301C	561 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	YPL077C	YPL077C	723 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	FAS2	YPL231W	5664 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	NOC2	YOR206W	2133 nt		4.03	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	STB2	YMR053C	2553 nt		4.03	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	LTV1	YKL143W	1392 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	SAS10	YDL153C	1833 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	NCR1	YPL006W	3513 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	SKM1	YOL113W	1968 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	BAT2	YJR148W	1131 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YLR122C	YLR122C	378 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	FSH3	YOR280C	801 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YBR138C	YBR138C	1575 nt		4.02	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	MRM2	YGL136C	963 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	SKI8	YGL213C	1194 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	BIO2	YGR286C	1128 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	GRE3	YHR104W	984 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YLR125W	YLR125W	411 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YBL059W	YBL059W	582 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	CUS2	YNL286W	858 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	STP22	YCL008C	1158 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	NHX1	YDR456W	1902 nt		4.01	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	RPO21	YDL140C	5202 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	NNK1	YKL171W	2787 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	HSP42	YDR171W	1128 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YDR282C	YDR282C	1245 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	OTU1	YFL044C	906 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YGL199C	YGL199C	471 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	MHO1	YJR008W	1017 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YMR082C	YMR082C	357 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	VMA1	YDL185W	3216 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	TDA11	YHR159W	1515 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	CHL1	YPL008W	2586 nt		4	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	MSE1	YOL033W	1611 nt		3.99	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	ACE2	YLR131C	2313 nt		3.99	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	COX4	YGL187C	468 nt		3.99	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	YLR036C	YLR036C	612 nt		3.99	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	TIF34	YMR146C	1044 nt		3.99	□□□□□ -1.77
ATG12	P38316	ASI2	YNL159C	870 nt		3.99	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.5 ms