Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN2P0C2S0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms