Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM3P06753 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM3P06753 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM3P06753 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM3P06753 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM3P06753 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM3P06753 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM3P06753 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM3P06753 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM3P06753 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM3P06753 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM3P06753 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM3P06753 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM3P06753 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM3P06753 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM3P06753 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM3P06753 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM3P06753 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM3P06753 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM3P06753 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM3P06753 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms