Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms