Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP73O15350 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TP73O15350 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP73O15350 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP73O15350 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP73O15350 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP73O15350 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP73O15350 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP73O15350 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TP73O15350 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TP73O15350 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP73O15350 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP73O15350 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TP73O15350 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP73O15350 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TP73O15350 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP73O15350 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP73O15350 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms