Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB6Q9Y5E3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms