Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC8Q9Y2L5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms