Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms