Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPREB3Q9UKI3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms