Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms