Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms