Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDAP2Q9NXN4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms