Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms