Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms