Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM167BQ9NRX6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms