Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZCCHC17Q9NP64 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms