Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPF3BQ9BZI7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
UPF3BQ9BZI7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms