Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACAP3Q96P50 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAP3Q96P50 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms