Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNE4Q8N205 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms