Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2L2Q86YR7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCF2L2Q86YR7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms