Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR88Q6ZMY6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms