Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A4Q6P5W5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms