Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB12Q6NXP0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms