Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOHLH1Q5JUK2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms