Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI3KQ59H18 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms