Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms