Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FXNQ16595 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FXNQ16595 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FXNQ16595 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FXNQ16595 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FXNQ16595 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FXNQ16595 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FXNQ16595 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FXNQ16595 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FXNQ16595 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FXNQ16595 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FXNQ16595 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FXNQ16595 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms