Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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