Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-12■■■■■ 44.1
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PCBP2Q15366 SKA2-206ENST00000581068 595 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-12■■■■■ 44.1
PCBP2Q15366 SKA2-208ENST00000583927 533 ntTSL 29.3□□□□□ -0.923e-12■■■■■ 44.1
PCBP2Q15366 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.983e-12■■■■■ 44.1
PCBP2Q15366 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-12■■■■■ 44.1
PCBP2Q15366 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.113e-12■■■■■ 44.1
PCBP2Q15366 SKA2-210ENST00000584089 229 ntTSL 45.21□□□□□ -1.583e-12■■■■■ 44.1
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PCBP2Q15366 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.126e-9■■■■■ 44
PCBP2Q15366 WWOX-209ENST00000563358 724 ntTSL 314.66□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 44
PCBP2Q15366 WWOX-206ENST00000561846 769 ntTSL 312.84□□□□□ -0.356e-9■■■■■ 44
PCBP2Q15366 WWOX-211ENST00000565791 1210 ntTSL 37.14□□□□□ -1.276e-9■■■■■ 44
PCBP2Q15366 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 44
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PCBP2Q15366 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.455e-11■■■■■ 44
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PCBP2Q15366 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.625e-11■■■■■ 44
PCBP2Q15366 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.235e-11■■■■■ 44
PCBP2Q15366 TMEM184B-210ENST00000488844 566 ntTSL 416.19■□□□□ 0.185e-11■■■■■ 44
PCBP2Q15366 TMEM184B-203ENST00000403210 586 ntTSL 58.68□□□□□ -1.025e-11■■■■■ 44
PCBP2Q15366 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 43.9
PCBP2Q15366 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 43.9
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PCBP2Q15366 PABPC1-210ENST00000519363 453 ntTSL 414.61□□□□□ -0.075e-51■■■■■ 43.9
PCBP2Q15366 SORBS3-203ENST00000517535 3067 ntTSL 219.54■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 43.9
PCBP2Q15366 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 43.9
PCBP2Q15366 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 43.9
PCBP2Q15366 CXXC5-210ENST00000509238 542 ntTSL 215.86■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 43.8
PCBP2Q15366 ARHGEF10L-201ENST00000167825 3018 ntTSL 213.06□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 43.8
PCBP2Q15366 ARHGEF10L-206ENST00000469726 4585 ntTSL 212.48□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 43.8
PCBP2Q15366 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 43.8
PCBP2Q15366 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 55.11□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 43.8
PCBP2Q15366 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.533e-8■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-8■■■■■ 43.7
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PCBP2Q15366 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.423e-8■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 322.19■■□□□ 1.143e-8■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 ZNF444-202ENST00000586123 574 ntTSL 422.15■■□□□ 1.141e-10■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 521.41■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 ZNF444-208ENST00000588358 642 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-10■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-8■■■■■ 43.7
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PCBP2Q15366 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 318.24■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 43.7
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PCBP2Q15366 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 415.08■□□□□ 03e-8■■■■■ 43.7
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PCBP2Q15366 RAD51B-204ENST00000469165 1158 ntTSL 36.54□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-203ENST00000468382 829 ntTSL 56.45□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-207ENST00000478014 618 ntTSL 36.31□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-224ENST00000557045 528 ntTSL 35.99□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 35.82□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 35.75□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 45.43□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 34.66□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 43.7
PCBP2Q15366 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 43.6
PCBP2Q15366 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 43.6
PCBP2Q15366 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 43.6
PCBP2Q15366 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 43.6
PCBP2Q15366 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 43.6
PCBP2Q15366 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.996e-8■■■■■ 43.6
PCBP2Q15366 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 43.6
PCBP2Q15366 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.532e-13■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-13■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-13■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-13■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-10■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-10■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 PES1-206ENST00000406208 871 ntTSL 512.05□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 516.1■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 DCAF5-204ENST00000553943 736 ntTSL 318.28■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 DCAF5-206ENST00000554681 759 ntTSL 211.56□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 43.5
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